Fondée en 1952 par les religieuses de la congrégation Sainte-Croix, l’école Saint-Clément qui aujourd’hui est l’école Saint-Clément-Est, s’établit tout à côté de l’église Saint-Joseph. On lui donne son nom en l’honneur du révérend Père Godefroy Clément, alors curé de la paroisse et père de la congrégation Sainte-Croix.

À son ouverture, l’école Saint-Clément dispense l’enseignement à plus de 500 enfants de Mont-Royal. Comme le nombre d’écoliers n’a cessé de croître, on agrandit l’école en 1995-1996 pour y ajouter l’aile sud. L’année suivante, elle compte quand même 750 enfants, du préscolaire à la sixième année. Malgré l’agrandissement, l’école est encore trop petite.

Grâce à une campagne active auprès du ministère de l’Éducation de la part de l’école et des parents, l’école Saint-Clément obtient en 1997 une seconde bâtisse sur l’avenue Regent, à deux pas de l’école. À partir de septembre 1997, l’Académie Saint-Clément accueille d’abord les élèves de 3e, 4e et 5e année, puis plus tard, seulement les élèves de 5e et 6e (3e cycle).

L’école Algonquin, aujourd’hui l’école Saint-Clément-Ouest, fut construite en 1953 en forme d’étoile. Chaque cycle d’enseignement loge dans une « pointe » de l’étoile. Jusqu’en août 1981, l’école est anglaise et fait partie de la CEPGM (Commission des écoles Protestantes du Grand Montréal). En septembre 1981, l’école Algonquin devient l’une des premières écoles françaises de la CEPGM. En juillet 1998, avec la restructuration des commissions scolaires, l’école Algonquin devient école de quartier et fait partie de la CSMB (Commission scolaire Marguerite-Bourgeoys).

En septembre 1999, avec le boom résidentiel dont bénéficie Mont-Royal depuis quelques années, l’école accueille de nouveau plus de 600 enfants. À compté du 1er juillet 2002, avec la hausse de clientèle à Saint-Clément, l’école Algonquin accueille les enfants de Mont-Royal afin de desservir adéquatement le territoire. Les écoles Saint-Clément et Algonquin deviennent une seule école à deux édifices. En septembre 2003, l’édifice EST accueille environ 650 enfants et l’édifice OUEST environ 350 enfants.

Depuis sa fondation, l’école Saint-Clément a toujours été en concurrence avec les diverses écoles privées qui desservent notre communauté. Relevant ce défi, l’école a su maintenir un haut calibre académique, si bien qu’elle jouit aujourd’hui d’une réputation enviable.

Depuis le 1er juillet 2015, l’école Saint-Clément est officiellement scindée en deux, l’école Saint-Clément-Est, sur le boulevard Laird, et l’école Saint-Clément-Ouest, sur la rue Mitchell, avec deux conseils d’établissement et deux équipes de direction distincte.